赣州市永磁磁浮技术研究中心以江西理工大学永磁磁浮技术与轨道交通研究院为主体，主要从事永磁磁浮技术、永磁磁浮轨道交通技术领域的科研工作。

研究中心下设磁浮技术基础研究所和磁浮技术工程研究所两个研究机构，并设置综合办公室和专家委员会两个常设机构。磁浮技术基础研究所下设悬浮与导向控制研究室、供电与牵引驱动技术研究室、智能控制系统研究室，核心任务是开展基础理论研究和人才培养工作。磁浮技术工程研究下设永磁磁浮轨道交通技术研究开发室和永磁磁浮技术应用研究开发室。